琵琶湖を中心とした水系。河川は野洲川・愛知川・姉川等。
琵琶湖を中心とした水系。河川は野洲川・愛知川・姉川等。 主要河川・湖沼: 琵琶湖/野洲川/愛知川/姉川/犬上川/安曇川/高時川。
琵琶湖固有のビワマス、姉川・高時川のアマゴ・イワナ。
| ID | 漁協名 | 所在地 | 管轄河川/湖 | 魚種 | 公式サイト |
|---|---|---|---|---|---|
| SH01 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（大津支所） | 滋賀県大津市 | 琵琶湖 | ニゴロブナ, ホンモロコ, ビワマス, ワカサギ, イサザ, シジミ | - |
| SH02 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（堅田支所） | 滋賀県大津市本堅田二丁目13-13 | 琵琶湖 | ホンモロコ, スゴモロコ, アユ, ワカサギ, シジミ | - |
| SH03 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（志賀支所） | 滋賀県大津市志賀 | 琵琶湖 | ホンモロコ, ワカサギ, コイ | - |
| SH04 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（瀬田支所） | 滋賀県大津市瀬田 | 瀬田川 | ウグイ, フナ, コイ | - |
| SH05 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（湖南支所） | 滋賀県栗東市 | 琵琶湖 | ニゴロブナ, ホンモロコ, ワカサギ | - |
| SH06 | 朝日漁業協同組合 | 滋賀県長浜市湖北町尾上144-14 | 琵琶湖 | ホンモロコ, ワカサギ, シジミ, アユ, フナ | 公式 |
| SH07 | 滋賀びわ湖漁業協同組合（近江八幡支部） | 滋賀県近江八幡市 | 琵琶湖, 内湖 | ニゴロブナ, ホンモロコ, ワカサギ | 公式 |
| SH08 | 非出資大戸川漁業協同組合 | 滋賀県大津市 | 大戸川 (大津市〜甲賀市境界一本松宮山井堰までの本流) | アユ | - |
| SH09 | 土山漁業協同組合 | 滋賀県甲賀市土山町 | 野洲川 (本流、野洲川ダム含む), 稲川 (野洲川支流), 田村川, 唐戸川, 山中川, 笹路川, 音羽谷川, 鰔川, 元越谷川, 白倉谷川 | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ, ウナギ, コイ, フナ, ワカサギ | - |
| SH10 | 愛知川漁業協同組合 | 滋賀県米原市 | 愛知川 (神田町御河辺橋〜政所町旧関電発電所堰堤、永源寺ダム含む), 和南川, 堂後川, 松尾谷川, 渋川, 樋の谷川, 佐目子谷川 | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ | - |
| SH11 | 安曇川漁業協同組合 | 滋賀県高島市安曇川町 | 安曇川 | アユ, アマゴ, ヤマメ | - |
| SH12 | 高島漁業協同組合 | 滋賀県高島市 | 鴨川 | アマゴ, アユ | - |
| SH13 | 朽木村漁業協同組合 | 滋賀県高島市朽木村 | 安曇川 | アマゴ, ヤマメ | - |
| SH14 | 大滝漁業協同組合 | 滋賀県彦根市 | 犬上川 (多賀町富之尾金屋頭首工から上流), 犬上川北流, 大杉川, 南後谷川, 黒谷川, 前谷川, 百々女鬼谷川, 御池谷川, 樋田ヶ谷川 | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ, ウナギ, コイ, フナ | - |
| SH15 | 余呉湖漁業協同組合 | 滋賀県長浜市 | 余呉湖 | ワカサギ, フナ, コイ | - |
| SH16 | 葛川漁業協同組合 | 滋賀県大津市葛川 | 葛川 | アマゴ, ヤマメ | - |
| SH17 | 勢多川漁業協同組合 | 大津市大石富川町岩屋50番地 | 大石川 (大津市大石龍門町通称大森の棚堰〜塩水橋上流200m), 信楽川 (大津市大石東町河川管理境界〜大石富川町尾越の棚), 加河川 (信楽川合流点〜奥加河井… | ニジマス, アマゴ, イワナ | - |
| SH18 | 日野町漁業協同組合 | 蒲生郡日野町西大路2871番地の3 | 日野川 (日野町村井日野川ダム洪水吐ゲート〜西大路和田橋直下西大路堰堤まで) | コイ, フナ | - |
| SH19 | 愛知川上流漁業協同組合 | 東近江市政所町1692番地2 | 愛知川 (政所町旧関電発電所堰堤から上流), 藤川谷, 御池川, 神崎川, 茶屋川 | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ | - |
| SH20 | 姉川上流漁業協同組合 | 米原市吉槻785番地の3 | 姉川 (米原市伊吹大橋下流280m〜上流), 板名古川, カラオ谷川, 足俣川, 起し又川, 向山谷川, 中津又川, 瀬戸山谷川 | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ | - |
| SH21 | 草野川漁業協同組合 | 長浜市野瀬町1023番地の10 | 草野川 (長浜市岡谷町大塚井堰から上流の草野川+各支流) | アユ, ニジマス, アマゴ, イワナ, ウナギ | - |
| SH22 | 高時川漁業協同組合 | 長浜市木之本町川合3番地の4 | 高時川 (木之本町古橋井明神橋下流100m〜大見発電所用水取水口堰堤), 杉野川 (中の崖まで、瀬谷川+谷川) | アユ, ニジマス, アマゴ | - |
| SH23 | 杉野川漁業協同組合 | 長浜市木之本町杉本919番地1 | 杉野川 (中の崖から上流)+向谷川+網谷川+須又川+落谷川+各支流 | アユ, アマゴ, イワナ, ウナギ | - |
| SH24 | 丹生川漁業協同組合 | 長浜市余呉町上丹生2556番地 | 高時川 (大見発電所用水取水口堰堤から上流), 摺墨川, 墓谷川, 小市川, 白谷川, 妙理川, 奥川並川, 鷲見川, 尾羽梨川, 針川, 音波川 | アユ, アマゴ, イワナ | - |
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